随着境外疫情的逐渐严重，境外的许多华人也开始了返华之旅，其中北京就是容纳最多境外人员的城市之一。大量的境外人员涌入也使得北京的疫情放防控医护资源感觉到吃紧，对此在时隔了17年之后，当年用于SARS定点治疗的小汤山医院也被重新启动。
为防控日益严重的境外输入疫情，北京市疫情防控领导小组决定，3月16日起启用小汤山医院，主要用于境外来京(返)京人员中的筛查、疑似病例及轻型、普通型确诊患者的治疗。
境外疫情严重这次海外疫情加剧，境外输入病例多日连续增长，北京医院的筛查与救治负担也明显增加。北京市新冠肺炎定点医院地坛医院连续两周筛查从机场转来的人员近千名，发现确诊病例23人。仅3月14日一天就筛查207人。此前地坛医院就已收治100多例北京本地感染者，这次海外多个国家疫情爆发，入境人员骤然增加，医院的筛查与救治不断承压。
北京境外疫情输入风险还将持续。截至3月16日14时，北京已经累计报告境外输入确诊病例37例，涉及6个国家。北京市疾控中心副主任庞星火在3月16日的新闻发布会上介绍，有27例确诊病例在入境时均有发热或呼吸道症状，有的还曾到当地医院就诊。
新冠疫情呈扩散之时，北京已着手启动小汤山的修缮改造工作。1月23日，也就是大年三十的前一天，近5000名建设者们进驻昌平区的小汤山施工。修缮改造工程包括固定病房楼、临时病房区和后勤保障区等。新建工程有病房、餐厅、锅炉房、医技楼、ICU等施工区域。新建病区病房为箱式房搭建而成，呈三层五排鱼骨状结构，由走廊与围廊连接。
设立床位小汤山医院设床位1000余张，主要用于北京海关检疫后有风险人员的进一步医学筛查。对确诊病例或疑似病例收进医院进行治疗，对筛查后未发现异常的旅客将由目的地省份以安全适宜方式运回本地，京内旅客由各区接回，实施集中隔离医学观察14天，实现闭环运行和管理。
小汤山医院扩建区域的病房设施、实验室检测、影像检查、消毒防护、污水处理、消防安全等所有设施均已验收合格。严格按照卫生防疫标准，完成了院内区域所有通道硬隔离，并设置单独出入口，实现各病区安全独立运行。
医护设施从市属医院中选派了数百名医护人员，专业涵盖呼吸、感染、重症、急诊、儿科、中医、检验、放射、药剂等，已完成系统的业务及防护培训。小汤山医院已与其他市级新冠肺炎收治定点医院形成远程会诊机制，促进医疗协同，分享经验。
